Enfeksiyon etkenleri; yapıları, biyolojik ve biyokimyasal özellikleri ile çok değişkendirler.
Birbirlerinden farklı enfeksiyon geliştirme mekanizmaları vardır.
Bakteri için insan vücudu; üremesi için gereken sıcaklığı, nemi ve gıdayı içeren uygun bir ekolojik çevredir.
Amaçları? Yaşamak… Yeterli sayıya ulaştıklarında…. Koloni oluşturmalarını destekleyecek fonksiyonlarını devreye sokarlar. Üremenin yan ürünleri ortaya çıkar (Gaz, asit vb.).
Konakta hasara yol açarlar.
Bakteriyel enfeksiyonların patogenezi; hastalığın belirti ve bulgularının gelişimine yol açan mekanizmaları içerir.
Hastalık gelişimi; bakterinin yol açtığı hasar ve enfeksiyona karşı gelişen doğal ve bağışık yanıtın bir sonucu olarak izlenir.

Patogenez ile ilişkili terimler:

Aderans (Adezyon, Tutunma): Bakterinin konak hücre yüzeyine yapışması
İnvazyon: Bakteri, parazit, mantar veya virüslerin konak hücrelere veya dokulara girişi ve vücutta yayılması
Enfeksiyon: Bir etkenin vücutta çoğalması. Normal flora bakterilerinin çoğalması enfeksiyon olarak kabul edilmez. Kişi asemptomatik bile olsa patojen bir bakterinin çoğalması enfeksiyondur.
Taşıyıcı: Asemptomatik enfeksiyonu olan ve etkeni başka bir insana bulaştıran kişi (ya da hayvan)
Patojen: Hastalığa sebep olabilen mikroorganizma
Nonpatojen: Patojen olmayan, normal floraya ait olabilen, hastalık yapmayan mikroorganizma
Oportunistik (fırsatçı) patojen: Konağın direnci (bağışıklık sistemi) bozuk olduğunda hastalığa sebep olan etken
Patojenite: Enfeksiyöz bir ajanın hastalık oluşturabilme yeteneği
Toksijenite: Mikroorganizmanın hastalığın gelişmesine katkısı olan toksin salgılama yeteneği
Virülans: Bir mikroorganizmanın hastalık oluşturma yeteneğinin derecesi. İnvazyon kabiliyeti ve toksijeniteyi de içerir. Yüksek virülansa sahip ajanlar az sayıda olduklarında bile hastalık oluşturabilirler.